Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RTL6Q6ICC9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RTL6Q6ICC9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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