Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALFQ53S48 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms