Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LACTB2Q53H82 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms