Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SP6Q3SY56 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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