Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL40Q2TBA0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms