Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIK5Q16478 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms