Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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