Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP4Q15650 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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