Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms