Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PTPRRQ15256 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PTPRRQ15256 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PTPRRQ15256 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTPRRQ15256 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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