Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC3Q15034 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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