Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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ERV3-1Q14264 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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ERV3-1Q14264 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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ERV3-1Q14264 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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ERV3-1Q14264 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERV3-1Q14264 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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