Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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