Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PWP1Q13610 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PWP1Q13610 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PWP1Q13610 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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PWP1Q13610 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PWP1Q13610 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PWP1Q13610 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms