Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms