Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PMS2P3Q13401 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PMS2P3Q13401 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PMS2P3Q13401 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PMS2P3Q13401 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMS2P3Q13401 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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