Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms