Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCB1Q12824 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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