Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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