Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms