Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms