Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM27E3Q08E93 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms