Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNB2Q08289 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms