Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AL163195.2-203ENST00000553604 573 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ANKRD7-201ENST00000265224 1298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ANKRD7-202ENST00000417525 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 BMS1P12-201ENST00000428213 706 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SFTA3-210ENST00000521945 1116 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SLC8A1-AS1-207ENST00000444629 935 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 GBP1P1-202ENST00000513638 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms