Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPCQ01831 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPCQ01831 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XPCQ01831 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XPCQ01831 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
XPCQ01831 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XPCQ01831 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
XPCQ01831 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XPCQ01831 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XPCQ01831 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms