Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms