Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms