Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIM1P81133 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIM1P81133 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIM1P81133 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms