Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2P78314 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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