Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms