Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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