Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms