Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACTBP60709 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACTBP60709 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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