Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms