Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms