Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP12AP54707 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms