Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCT3P49368 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCT3P49368 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCT3P49368 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms