Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XCR1P46094 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XCR1P46094 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XCR1P46094 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms