Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms