Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms