Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms