Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RORAP35398 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RORAP35398 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RORAP35398 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms