Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms