Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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