Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMGB2P26583 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB2P26583 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms