Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XPAP23025 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XPAP23025 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XPAP23025 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XPAP23025 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XPAP23025 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XPAP23025 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XPAP23025 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XPAP23025 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XPAP23025 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XPAP23025 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XPAP23025 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XPAP23025 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XPAP23025 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XPAP23025 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XPAP23025 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms