Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF1P22415 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms