Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DPA1P20036 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms