Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AMD1P17707 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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AMD1P17707 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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AMD1P17707 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMD1P17707 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMD1P17707 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMD1P17707 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMD1P17707 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMD1P17707 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMD1P17707 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMD1P17707 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMD1P17707 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMD1P17707 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMD1P17707 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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