Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRT10P13645 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT10P13645 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms